Издательство СО РАН

Издательство СО РАН

Адрес Издательства СО РАН: Россия, 630090, а/я 187
Новосибирск, Морской пр., 2

soran2.gif

Baner_Nauka_Sibiri.jpg


Яндекс.Метрика

Поиск по журналу

Журнал структурной химии

2012 год, номер 2

ВЛИЯНИЕ СТРУКТУРНЫХ ХАРАКТЕРИСТИК ИНГИБИТОРОВ ДИГИДРОФОЛАТРЕДУКТАЗЫ НА ИХ МЕТАБОЛИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА

Е. С. Афонькина1, Н. Н. Палько2, Г. А. Матвеев3, Н. А. Тореева1, В. А. Потемкин2, М. А. Гришина2
1 Челябинский государственный университет
2 Челябинская государственная медицинская академия
3 Институт программных систем РАН
: elena-chelyabinsk@hotmail.com, pva@modelchem.ru
Ключевые слова: взаимосвязь структуры и свойств, молекулярный докинг, дигидрофолатредуктаза, конформационный анализ, сокращенные контакты, метаболиты, комплекс ?рецептор-лиганд?, туберкулостатические средства
Страницы: 364-371

Аннотация

Определена ориентация производных дигидропиримидина, содержащих подандные цепи, в модельном рецепторе при помощи алгоритма СiS. Проведено сравнение ориентации соединений с подандными цепями с расположением соединений без подандных цепей в модельном рецепторе. Проанализированы фармакофорные и антифармакофорные части соединений. Определены аминокислотные остатки, отвечающие за эффективные взаимодействия соединений с подандными цепями с сайтом связывания дигидрофолатредуктазой (ДГФР) с использованием данных РСА. Предложен механизм действия туберкулостатических соединений, содержащих в своем составе подандные цепи, который предполагает, что исследуемые молекулы подвергаются метаболизму на цитохроме Р450 изоформы 3А4, образуя метаболиты. Наибольшей активностью обладают метаболиты, не содержащие фрагменты подандных цепей, которые взаимодействует с ДГФР. Таким образом, соединения, содержащие подандные цепи, являются пролекарствами.