Характеристика сообществ микроорганизмов из оз. Байкал, развивающихся на стальной пластине и в природной воде, окружающей данный субстрат
В.В. Мальник1, В.В. Парфенова1, О.А. Тимошкин1, А.Н. Сутурин1, Н.С. Павловская2
1Лимнологический институт СО РАН, 664033, Иркутск, ул. Улан-Баторская, 3
malnik80@mail.ru
2Сибирский институт физиологии и биохимии растений СО РАН, 664033, Иркутск, ул. Лермонтова, 132
Ключевые слова: биопленка, оз. Байкал, микроорганизмы, 16S рРНК, РНК-полимераза, ген rpoC, клонирование
Страницы: 769-777
Аннотация
Представлен анализ микробного сообщества, развивающегося на пластине из нержавеющей стали. Сделан анализ пробы по гену rpoC с этой пластинки. Идентификация доминирующих видов (клонов) биопленки проведена с использованием молекулярного клонирования и определения нуклеотидной последовательности участка гена 16S рРНК. Представлено сравнение активностей микроорганизмов, ведущих планктонный образ жизни и прикрепленных в биопленке. Обнаружено, что 7 из 19 секвенированных последовательностей (37 %) принадлежали к группе Sphingobacteria. Анализ нуклеотидных последовательностей гена 16S рРНК, клонированных из природных биопленочных образцов оз. Байкал, выявил широкое разнообразие микроорганизмов, входящих в состав биопленки. Среди них отмечены следующие таксономические группы: сфингобактерии, α-протеобактерии, цианобактерии, веррукомикробии, бациллы, γ-протеобактерии, флавобактерии и β-протеобактерии. Подобный анализ проведен для оз. Байкал впервые.
|
