МОДЕЛИРОВАНИЕ КОМПЛЕКСОВ ИЗОФОРМЫ 1A2 ЦИТОХРОМА P450 С СУБСТРАТАМИ
А. А. Погребной1, М. А. Гришина2, В. А. Потемкин3
1 Челябинский государственный университет, alpha@74mail.ru 2 Челябинский государственный университет 3 Челябинский государственный университет
Ключевые слова: докинг, моделирование, комплекс, субстрат, РСА, P450, 1A2, 2HI4
Страницы: 852-858
Аннотация
С применением 3D-QSAR алгоритма CiS проведено моделирование комплексов 17 субстратов с изоформой 1A2 цитохрома P450 при использовании в качестве основы для моделирования комплекса 2HI4 из базы данных PDB. Рассмотрено расположение молекул субстратов в полости изоформы 1A2, проанализирована ориентация реакционных центров молекул относительно гема и исследован характер взаимодействия между субстратами и аминокислотными остатками активного сайта. Структуры полученных при моделировании комплексов позволяют объяснять направление метаболизма в случае реакций деметилирования и ряда реакций гидроксилирования, что делает возможным применение алгоритма CiS для прогнозирования направления процессов метаболизма.
|