ИЗМЕНЕНИЕ ВТОРИЧНОЙ СТРУКТУРЫ БЕЛКА HMGB1 ПРИ СВЯЗЫВАНИИ С ДНК
Т. Ю. Родионова1, Е. В. Чихиржина2, В. И. Воробьев3, А. М. Поляничко4
1 Санкт-Петербургский государственный университет Институт цитологии РАН
2 Институт цитологии РАН, chikhir@gmail.com
3 Санкт-Петербургский государственный университет Институт цитологии РАН
4 Санкт-Петербургский государственный университет Институт цитологии РАН, polyanichko@gmail.com
Ключевые слова: HMGB1, ДНК, ДНК-белковые взаимодействия, круговой дихроизм
Страницы: 1014-1020
Аннотация
С помощью спектроскопических методов и гель-ретардации исследована стадия некооперативного взаимодействия негистонового хромосомного белка HMGB1 с ДНК. Установлено, что комплексообразование сопровождается компактизацией молекулы ДНК в достаточно широком диапазоне отношений белок/ДНК в комплексе. Методом кругового дихроизма было показано, что при связывании с ДНК изменяется вторичная структура белка HMGB1. Установлено, что изменения в структуре белка происходят в условиях избытка мест связывания белка на ДНК и завершаются при соотношении ~40-50 пар оснований на молекулу белка, при этом степень α-спиральности HMGB1 в комплексе увеличивается на 20 % по сравнению со свободным состоянием. Предполагается, что изменение вторичной структуры HMGB1 при связывании с ДНК лежит в основе механизмов многообразных функций, выполняемых этим белком в клетке.
|
