ФЛУОРЕСЦЕНТНЫЕ МЕТКИ. ДАНСИЛАМИД (CH3)2Nв€’С10Н6в€’SO2NH2, ОТРАЖЕНИЕ КОНФОРМАЦИОННЫХ СВОЙСТВ СВОБОДНОЙ МОЛЕКУЛЫ В КРИСТАЛЛИЧЕСКИХ СТРУКТУРАХ
Н.И. Гиричева, Е.А. Лапыкина, М.С. Фёдоров, Д.А. Петрова
Ивановский государственный университет, 153025 Россия, Иваново, ул. Ермака 39 n.i.giricheva@mail.ru
Ключевые слова: дансиламид, конформеры, переходные состояния, NBO-анализ, квантово-химические расчеты, взаимосвязь структур кристалл-газ, dansyl amide, conformers, transition states, NBO analysis, quantum chemical calculation, crystal-gas structures interaction
Страницы: 667-675 Подраздел: ТЕОРИЯ СТРОЕНИЯ МОЛЕКУЛ И ХИМИЧЕСКОЙ СВЯЗИ
Аннотация
Изучены конформационные свойства молекулы дансиламида (CH3)2N-C10Н6-SO2NH2, который широко используется для флуоресцентного мечения веществ, например аминокислот или нуклеотидов, и веществ, способных образовывать жидкие кристаллы. Установлено, что молекула имеет шесть конформеров с относительной энергией 0/0,13, 1,13/1,38, 0,06/0,06, 0,31/0, 2,95/2,70, 0,31/0 (методы DFF/B3LYP/cc-pVTZ и МР2/cc-pVTZ соответственно). Во всех конформерах нафталиновый остов под действием двух заместителей становится неплоским. Рассмотрено влияние природы заместителей на геометрические параметры конформеров. В терминах NBO-анализа дается объяснение существенному отклонению связи S-N заместителя -SO2NH2 от ортогонального, а также несимметричному положению группы -N(СH3)2 относительно нафталинового остова. Определены пути и барьеры конформационных превращений молекулы дансиламида. Выполнен анализ строения фрагмента (CH3)2N-C10H6-SO2NН-X в кристаллах и установлена взаимосвязь между относительной энергией конформеров свободной молекулы и вероятностью реализации их структуры в кристаллах.
DOI: 10.15372/JSC20150403 |