ВАЛИДАЦИЯ ГЕТЕРОФАЗНОГО АНАЛИЗА РНК С ПОМОЩЬЮ КНИ-БИОСЕНСОРА
Е.В. Дмитриенко1,2, А.В. Порываева1, О.В. Наумова3, Б.И. Фомин3, М.С. Купрюшкин1, И.А. Пышная1, Д.В. Пышный1,2
1Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, г. Новосибирск, Россия elena.dmitrienko@niboch.nsc.ru 2Новосибирский государственный университет, г. Новосибирск, Россия pyshnyi@niboch.nsc.ru 3Институт физики полупроводников им. А. В. Ржанова СО РАН, г. Новосибирск, Россия naumova@isp.nsc.ru
Ключевые слова: КНИ-биосенсор, Si/SiO-поверхности, гетерофазный анализ, гибридизация, электронейтральные фосфорилгуанидиновые олигонуклеотиды
Страницы: 50-56
Аннотация
Анализ нуклеиновых кислот остаётся актуальным направлением в развитии медицинской диагностики. Современные ультрачувствительные диагностические системы позволяют преобразовать специфичное взаимодействие при проведении анализа в аппаратно-регистрируемый сигнал. Пример таких диагностических устройств - биосенсоры на основе КНИ (кремний-на-изоляторе) полевых транзисторов. В данной работы использовались стеклянные поверхности (в качестве Si/SiO2-поверхности КНИ-биосенсора) для оптимизации и апробации всех этапов анализа. Продемонстрирована эффективная иммобилизация электронейтральных аналогов олигонуклеотидов на Si/SiO2-поверхность после активации Si-OH групп 3-глицидоксипропилтриметоксисиланом или карбонилдиимидазолом. В условиях низкой концентрации соли и при её отсутствии показана возможность детекции РНК-мишени на модельных стеклянных поверхностях в режиме параллельного анализа. Продемонстрированы регенерация Si/SiO2-поверхности сенсоров для проведения повторного анализа, а также стабильность сенсоров при длительном хранении.
DOI: 10.15372/AUT20210106 |