Моделирование ориентации молекул лекарственных средств в полости рецептора в рамках алгоритма BiS
Потемкин В.А., Гришина М.А., Барташевич Е.В.
Челябинский государственный университет
Ключевые слова: биологическая активность, 3D QSAR-метод, структуры комплексов «рецептор—лиганд», «хозяин—гость»
Страницы: 153-158
Подраздел: СУПРАМОЛЕКУЛЯНЫЕ И НАНОРАЗМЕРНЫЕ СИСТЕМЫ
Аннотация
Предложен алгоритм BiS для моделирования ориентации молекул лекарственных средств в полости рецептора, основанный на предположении комплементарности поля биологически активных соединений полю рецептора, на котором они осуществляют действие. Сопоставление расчетных ориентаций биологически активных соединений различных классов на соответствующих рецепторах с данными рентгеноструктурного анализа (Protein Data Bank) показало, что результаты, полученные в рамках данного подхода, значительно лучше имеющихся в литературе. Предложенный метод позволил выявить детали механизма действия ДНК-антиметаболитов, ингибиторов дигидрофолатредуктазы. Найдена зависимость величины активности от параметров строения комплексов ² рецептор—лиганд² .
|
