Иммуногенетическая характеристика потенциальных неродственных доноров ГСК, проживающих на территориях Свердловской, Саратовской, Ярославской и Владимирской областей
С.С. Кутявина, М.А. Логинова, Д.Н. Смирнова, О.А. Махова, И.В. Парамонов
Кировский НИИ гематологии и переливания крови ФМБА, Киров, Россия kss1993@bk.ru
Ключевые слова: HLA-типирование, секвенирование, аллели, гаплотипы, доноры гемопоэтических стволовых клеток, HLA typing, sequencing, alleles, haplotype, hematopoietic stem cells donors
Страницы: 53-65
Аннотация
Цель исследования - изучить особенности распределения HLA-аллелей и мультилокусных гаплотипов у потенциальных доноров гемопоэтических стволовых клеток, проживающих на территориях Свердловской, Саратовской, Ярославской и Владимирской областей. Материал и методы. Проведено HLA-типирование по технологии Sequence Based Typing 2683 образцов цельной крови, полученных от потенциальных неродственных доноров гемопоэтических стволовых клеток, рекрутированных в Свердловской ( n = 1018), Саратовской ( n = 825) Я (рославской ( n = 604) и Владимирской ( n = 236) областях. Частоты HLA-аллелей и гаплотипов определены методом максимального правдоподобия с помощью EM-алгоритма для полилокусных данных. Результаты и их обсуждение. В ходе проведенных исследований во всех четырех изученных популяциях выявлено 16 аллельных вариантов локуса HLA-А, 13 - локуса HLA-С, 13 - локуса HLA-DRB1. В локусе HLA-В в популяциях Свердловской и Ярославской областей обнаружено 28 аллельных вариантов, в Саратовской - 27, во Владимирской - 25. Частотами встречаемости выше 10 % характеризуются аллельные варианты HLA-A*02, HLA-A*03, HLA-A*01, HLA-A*24, HLA-B*07, HLA-B*35, HLA-С*07, HLA-С*06, HLA-С*04, HLA-С*03, HLA-С*12, HLA-DRB1*15, HLA-DRB1*07, HLA-DRB1*01, HLA-DRB1*13, HLA-DRB1*04, HLA-DRB1*11. Самым распространенным четырехлокусным гаплотипом во всех исследованных популяциях является гаплотип HLA-A*01-B*08-C*07-DRB1*03, на долю которого в Свердловской, Ярославской и Владимирской областях приходится более 4,0 % (4,4, 4,9 и 4,2 % соответственно), а в Саратовской области частота его встречаемости составляет 3,2 %. У жителей Свердловской и Саратовской областей выявлено четыре новых HLA-аллеля, зарегистрированных в Комитете по номенклатуре HLA-аллелей ВОЗ.
http://sibmed.net/article/852/snmzh_5-2020_kutyavina_i_dr.pdf
DOI: 10.15372/SSMJ20200506 |