Микобиота донных грунтов прибрежной зоны озера Байкал
М.Д. Федорова, А.В. Кураков
Московский государственный университет им. М. В. Ломоносова, Москва, Россия kurakov57@mail.ru
Ключевые слова: грибы, Байкал, донный грунт, таксономическая структура, видовое разнообразие, метод посева, высокопроизводительное секвенирование ITS2 участка рДНК
Страницы: 504-522
Аннотация
На основе культурального метода и высокопроизводительного секвенирования ITS2 участка рДНК определена численность колониеобразующих единиц (КОЕ), таксономическая структура и видовое богатство грибных сообществ в донных грунтах озера Байкал с глубин от 9 до 178 м. Выявлено 215 видов, 138 родов, 50 порядков, 22 класса, 6 отделов - Ascomycota, Basidiomycota, Mucoromycota, Mortierellomycota, Chytridiomycota, Glomeromycota. Только ДНК-баркодинг позволил обнаружить представителей отделов Chytridiomycota, Glomeromycota и Rozellomycota. Культуральными методами и высокопроизводительным секвенированием ITS2 участка рДНК в грунтах выявлено 77 и 146 видов соответственно, и только восемь видов установлено обоими подходами. Большая часть нуклеотидных последовательностей не была идентифирована до уровня семейств и видов. В составе микобиоты грунтов есть представители различных эколого-трофических групп - сапротрофов, патогенов, симбиотрофов. Это преимущественно психротолерантные организмы, среди них есть факультативно-анаэробные виды. Установлены изменения таксономической структуры грибных сообществ в зависимости от глубины и виды, способные функционировать в грунтах. Это, в частности, Pseudeurotium bakeri, Pseudeurotium hygrophilum, Pseudogymnoascus pannorum, Pseudogymnoascus roseus, Trichoderma hamatum, Trichoderma harzianum, Trichoderma lixii, Trichoderma polysporum, Penicillium glandicola, Penicillium swiecickii, виды родов Rhizophydium, Fusarium, Daldinia, Mortierella, Coniochaeta, Cystobasidium, Mrakia, Rhodothorula, Solicoccozyma и ряд других. Создана коллекция штаммов грибов, изолированных из донных грунтов Байкала.
DOI: 10.15372/SEJ20230409 EDN: BKDZIS
|